Fons van der Linden studeerde clavecimbel, orgel en muziektheorie aan het Conservatorium in Maastricht. Aansluitend studeerde hij nog clavecimbel bij Jos van Immerseel aan het Antwerps Conservatorium en behaalde het Hoger Diploma met onderscheiding.
In 1989 en 1990 maakte hij een Europese tournee als clavecinist van het European Community Baroque Orchestra o.l.v. Ton Koopman. In 1992, 1997 en 1999 bezocht hij Japan. In 1994 behaalde hij nog een onderwijsbevoegdheid (DM) voor piano. Ook werkte hij mee aan de cd "Historische orgels in Limburg".
Fons van der Linden is organist van de Waalse Kerk in Maastricht en begeleider van diverse koren. Hij is voorzitter van de Stichting Oude Muziek Limburg en vicevoorzitter van het Nederlands Clavecimbel Genootschap. Hij geeft les aan diverse muziekscholen in Limburg en Luxemburg.
